פלורנס לא היה קיים כשדה תעופה לפני המלחמה. בשנת 1942 ראה הלופטוואפה פער בהגנה האווירית שלו בין סן-טרונד לריימס והחל לבנות את כיכר פלוגפלאץ 401 ברמת פלורנס-ז'וזיין. הבנייה הסתיימה ביוני 1943 ואירחה תחילה מטוסי קרב ליליים מדגם מסרשמיט Bf 110, ומאוחר יותר מטוסי יונקרס Ju 88 מצוידים במכ"ם. בנובמבר 1943 הגיעו מטוסי קרב יומיים מדגם פוקה-וולף 190 מדגם יאגשוואדר 26, כאשר מתקפת היום האמריקאית התעצמה. באוגוסט 1944 נסוגו הגרמנים, הטיסו את המטוס האחרון לגרמניה והרסו את המתקנים.

חיילים אמריקאים הגיעו לפלורנס ב-3 בספטמבר 1944 והשדה היה פעיל תחת השם A-78 ז'וזיין ב-11 בספטמבר. טייסת קרב הלילה ה-422 הגיעה עם מטוסי ה-P-61 בלאק ווידווס ב-16 בספטמבר, ואחריה ה-P-38 לייטנינג של קבוצות הקרב ה-370 וה-474, אשר זכו ל-54 ניצחונות אוויריים, בעיקר בקרב על הבליטה. מטוסי ה-P-47 ת'אנדרבולט של קבוצת הקרב ה-365 החליפו את ה-370 בסוף ינואר 1945, ומטוסי ה-B-26 מאראודר של קבוצת הפצצה ה-344 ביצעו כמה מההתקפות האחרונות על גרמניה מכאן.

האמריקאים עזבו לתמיד ב-15 בספטמבר 1945. ויקיפדיה בשפה האנגלית מציינת את 1936 כתאריך הבנייה, דבר שסותר את ההיסטוריה של הבסיס עצמו: לא היה שדה תעופה לפני העבודות הגרמניות של 1942–1943. ויקיפדיה בשפה הצרפתית מוסיפה כי מטוס ה-B-24 ליבראטור הראשון נחת ב-11 בספטמבר 1944 ומטוסי ה-B-26 הראשונים של הרגימנט ה-344 ב-5 באפריל 1945. לאחר עזיבת האמריקאים, יחידה בלגית קטנה שמרה על השדה שניזוק בסדר עד 1946 עד שחיל האוויר החדש החליט מה לעשות איתו.

כאשר הוקם חיל אוויר בלגי עצמאי ב-15 באוקטובר 1946, נבחרה פלורנס כבסיס קרב בתחילת 1947. כנף הקרב של היום ה-161 נועדה לכלול שתי טייסות של מטוסי ספיטפייר XIV; טייסיה הראשונים הגיעו באוקטובר 1947 עם מטוס איירספיד אוקספורד אחד ושני מטוסי הרווארד לאימונים, ושני הספיטפיירים הראשונים ב-15 באוקטובר. בפברואר 1948 הפכה הכנף לכנף הקרב של היום השני, עם טייסות 1 ו-2. עד ינואר 1949 רק 17 מטוסי ספיטפייר היו שמישים והסוג כבר היה מיושן.

מטוסי סילון הגיעו ב-18 באפריל 1951 עם מטוסי ה-F-84 ת'אנדרג'ט הראשונים, שהספיקו לשלוש טייסות, ותוכנית בנייה העניקה לאזורי ז'וזיין, קורן ובואה דויין האנגרים חדשים ומוקדי פיזור. מסלול המראה ראשי חדש נפתח ב-1953. בין השנים 1955 ו-1957 בלגיה החליפה את מטוסי ה-F-84G שלה ב-197 מטוסי F-84F ת'אנדרסטריק מסיוע צבאי אמריקאי, והת'אנדרסטריק שהה בפלורנס במשך 17 שנים. היסטוריית הבסיס מתארכת את טיסת העל-קולית הראשונה בבלגיה של שני מטוסי כנף שנייה ל-17 באוגוסט 1955; כתבה מאוחרת יותר על הבסיס מציינת את ה-30 באוגוסט 1955, ושמותיהם של מייג'ור ברנדרס וקפטן לאלו.

בין השנים 1964 ל-1966 החזיקה האגף בכוננות גרעינית של נאט"ו עם ארבעה מטוסי F-84F מוכנים לשיגור תוך 15 דקות, בסיוע ניחוש אמריקאי. בשנות ה-60 הצטרפו שתי הטייסות לכוחות התגובה הניידים של נאט"ו, טייסת 1 ככוח ראשוני לאזור הדרומי וטייסת 2 כטייסת עתודה בצפון. ב-12 באוקטובר 1962 אימצה האגף את סמל ראש חזיר הבר ואת קריאת הציד "Taïaut". על פי ויקיפדיה בשפה הצרפתית, הבסיס נקרא על שם ז'אן אופנברג, טייס הקרב הבלגי שנהרג ב-1942, בשנת 1956.

בפברואר 1968 הזמינה בלגיה 106 מטוסי מיראז' 5, שחולקו ל-63 מטוסי קרב-מפציצים מדגם BA, 16 מטוסי BD דו-מושביים ו-27 מטוסי סיור מדגם BR. הראשון הגיע לפלורנס ב-29 ביוני 1970, טייסת 2 הייתה מבצעית בסוג זה ביוני 1971, וטייסת 42 הגיעה ב-15 באפריל 1971 כדי להמיר אותה לגרסת הסיור. טיסת ה-F-84F האחרונה עם טייסת 1 הייתה ב-30 ביוני 1971. טייסות המיראז' שובצו בחזית הגרמנית, החל מסיוע קרוב ליד מסך הברזל ועד לתקיפות עמוקות.

בלגיה הזמינה 116 מטוסי F-16 בשנת 1975 ועוד 44 בשנת 1983. מטוס ה-F-16 הראשון של הכנף הטקטית השנייה נחת ב-14 באוקטובר 1988, טייסת 1 הצטרפה לטייסת 2 מהסוג הזה במרץ 1989 וטייסת 42, שעדיין הייתה במיראז', יצאה לבירסט. ב-4 במרץ 1996, טייסת 350, אחת משתי טייסות בלגיות של חיל האוויר המלכותי הבריטי בזמן המלחמה, הגיעה מבובשן, ונתנה לבסיס שוב שלוש טייסות וכוננות תגובה מהירה של 24 שעות ביממה עם שני מטוסי סילון חמושים בכל 15 דקות.

מטוסי ה-F-16 של פלורנס טסו מוילהפרנקה מאוקטובר 1996, מאמנדולה מינואר 1999, ובין ה-24 במרץ ל-10 ביוני 1999, כל שלוש הטייסות השתתפו בתקיפות על סרביה וקוסובו. מטוסי F-16 משודרגים הגיעו מספטמבר 2000 והמטוס האחרון שלא עבר שינוי עזב באפריל 2004. טייסת 2 פורקה בשנת 2001. לאחר מכן הגיעו מטוסי אפגניסטן (2005–2014), לוב (2011) והמערכה נגד המדינה האסלאמית מירדן (משנת 2014). עד שנת 2023 צי הבסיס ירד לכ-20 מטוסי F-16.

הפרק השנוי במחלוקת ביותר של פלורנס החל בתשובת נאט"ו ל-SS-20 הסובייטי: פרשינג II וטילי שיוט קרקעיים בחמש מדינות אירופאיות. בלגיה היססה זמן רב יותר מרוב מדינות אירופה, ותנועת השלום מילאה את רחובות בריסל: 40,000 צועדים בדצמבר 1979, 200,000 ב-1981 ו-400,000 באוקטובר 1983, על פי דיווח ויקיפדיה בשפה הצרפתית על משבר הטילים האירופיים.

תולדות הבסיס מספרות כי אנשי הכנף הטקטית ה-485 של חיל האוויר האמריקאי הגיעו ב-15 במרץ 1984, על רקע הפגנות עזות נגד הגרעין, וכי היחידה הייתה מבצעית במלואה באוגוסט 1985 עם 16 הטילים המתוכננים ויותר מ-1,000 אנשי צוות אמריקאים. דיווחים שמקורם בארה"ב מתארכים את הפעלת הכנף בפלורנס לאוגוסט 1984 ומתעדים מחאות תקופתיות של תנועות שלום ליד השער הראשי. הנתונים שונים: הבסיס מונה 16 טילים, בעוד שערך אנציקלופדיה על BGM-109G מציין את טייסת הטילים הטקטית ה-71 של הכנף 48, ככל הנראה את ההקצאה המלאה ולא את מה שנפרס.

אמנת ה-INF מ-8 בדצמבר 1987 אסרה על שיגור טילים קרקעיים בעלי טווחים של 500 עד 5,500 ק"מ. צוות פיקוח סובייטי בן עשרה אנשים ביקר בפלורנס באוגוסט 1988 כדי לבדוק את עמידה בדרישות, והאמריקאים האחרונים עזבו ב-28 בפברואר 1989, ובכך סיימו את משימת הטילים על אדמת בלגיה. הכנף הושבתה מאוחר יותר באותה שנה; שורשי השלטון המסוכמים בוויקיפדיה מציגים את ה-30 בספטמבר 1989. אתר כנף הטילים הריק לא נשאר בטלה זמן רב: תוך שבועות הוא קיבל דייר חדש ולא גרעיני של נאט"ו.

בנייני כנפי הטילים הריקים לא נשארו ריקים. במרץ 1989 נכנסה לתפקיד תוכנית המנהיגות הטקטית של נאט"ו. היא נוסדה בינואר 1978 בפירסטנפלדברוק על ידי גרמניה, בלגיה, קנדה, ארצות הברית, הולנד ובריטניה, עברה ליבר בספטמבר 1979 והגיעה לפלורנס עם שמונה מדינות חברות. מטרתה הייתה להעניק לכוחות האוויר של נאט"ו במרכז אירופה דוקטרינה טקטית משותפת על ידי אימון משותף של מנהיגי מבנה ומשימות עתידיים.

בפלורנס היא ערכה שישה קורסים בני ארבעה שבועות בשנה, שכל אחד מהם הביא עד 30 מטוסים וכ-500 אנשי צוות לבסיס. מספר החברים השתנה במהלך שני העשורים: איטליה ודנמרק הצטרפו ב-1996, קנדה עזבה ב-1997 וספרד הצטרפה ב-2002, על פי דיווח ויקיפדיה בשפה הספרדית. יוון וצרפת הצטרפו ב-2009, השנה בה התוכנית עזבה את בלגיה, מה שהעניק לה את עשר החברים הקבועים שיש לה כיום: בלגיה, דנמרק, צרפת, גרמניה, יוון, איטליה, הולנד, ספרד, בריטניה וארצות הברית.

עד שנות ה-2000 הטקטיקות עברו לגובה בינוני וגבוה, והמרחב האווירי ומזג האוויר הבלגי כבר לא התאימו לתוכנית הלימודים. לאחר 20 שנה התוכנית יצאה לאלבסטה שבספרד; הבסיס מתארך את היציאה ל-30 ביוני 2009, ויקיפדיה בשפה האנגלית ל-31 ביולי 2009, והאתר החדש נחנך ב-1 באוקטובר 2009. ויקיפדיה בשפה הצרפתית מעריכה את העלות המקומית בכ-50 משרות.

כלי טיס המופעלים מרחוק הגיעו לפלורנס בשנת 2011, כאשר טייסת 80 של כט"מ עברה לפלורנס עם ה-B-Hunter שתוכנן בישראל, בשירות בלגי מאז 2002. הוא טס בבוסניה בשנת 2005, במהלך הבחירות בקונגו בשנת 2006 ומעל נמל אנטוורפן במסגרת מעקב לוחמה בטרור משנת 2015, והוצא משימוש כמיושן בספטמבר 2020. יורשו, ה-MQ-9B SkyGuardian, הוזמן בשנת 2020: ארבעה מטוסים ושתי תחנות קרקע. הראשון טס בקליפורניה בפברואר 2025, הגיע לפלורנס באמצעות A400M ב-18 באוגוסט 2025 והוכנס לשירות שם ב-23 בספטמבר 2025 עם טייסת 2 "קומט" שהופעלה מחדש.

בלגיה בחרה ב-F-35A בשנת 2018 והזמינה 34; עבודות הבנייה של קומפלקס F-35 בשטח של 50,000 מ"ר בפלורנס, הכולל ארבעה סימולטורים, החלו ב-22 במאי 2023. שמונת המטוסים הבלגיים הראשונים שהו בבסיס חיל האוויר לוק באריזונה לאימונים. ב-13 באוקטובר 2025 נחתו שלושת הראשונים בפלורנס עבור טייסת 1, שהוטסה מארצות הברית דרך האיים האזוריים; ראש ההגנה ושר ההגנה המתינו. טייסת 10 הופעלה מחדש באותה שנה כדי להפעיל את הסימולטורים ולתמוך בסוג.

מקורות סופרים את ההגעה באוקטובר 2025 בצורה שונה: משרד ההגנה הבלגי אומר שלושה והבסיס מציין את FL009, FL010 ו-FL012; היסטוריה סידורית מיוחדת מפרטת את FL009 עד FL012, ו-Aviation24 סופר ארבעה. שלושה נוספים הצטרפו בספטמבר 2026, כאשר הבסיס מתוארך ל-17 בספטמבר, Belgian Wings ל-18 בספטמבר ו-Aviation24 ל-25 בספטמבר, מה שמביא את סך כל מטוסי פלורנס לשבעה. כושר מבצעי ראשוני מתוכנן לקיץ 2027, כאשר קליין-ברוגל תקבל את ארבעת מטוסי ה-F-35 הראשונים שלה; 11 נוספים הוכרזו בפברואר 2026 עבור צי של 45.