De FAE dateert Ala de Combate 23 van dinsdag 24 oktober 1978, de dag waarop de eenheid werd opgericht op de nieuwe basis Aérea Eloy Alfaro aan de weg van Manta naar Jaramijó. De eerste vliegtuigen waren BAC Strikemaster Mk 89's, waarvan Ecuador er in totaal 28 kocht. Later voegden Cessna A-37B's zich daarbij, en in maart 1981 werden er AT-33 bewapende trainingsvliegtuigen aan de vloot toegevoegd.

De lichte straaljagers van Manta werden in 1995 ingezet in de oorlog. De Spaanse Wikipedia vermeldt Strikemasters en A-37B's die vanaf 3 februari Peruaanse posities in de Cenepa-vallei aanvielen onder begeleiding van jagers, en een AT-33 die tijdens de oorlog bij een ongeluk op Manta verloren ging. De officiële missie van de wing omvat tegenwoordig offensieve luchtverdediging, interceptie, luchtsteun, verkenning en luchtpatrouille.

De Strikemasters vormden een aanzienlijke vloot voor een kleine luchtmacht: de Engelstalige Wikipedia telt 22 Mk 89's en zes Mk 89A's die aan Ecuador werden geleverd. Ze bleven lang na de oorlog in dienst; een ervan stortte neer tijdens een trainingsmissie nabij de Colombiaanse grens op 25 maart 2009, het jaar voordat de eerste Super Tucano's arriveerden om ze te vervangen. De pagina van de FAE over de wing vermeldt de Strikemaster, de A-37B, de AT-33 en de A-29 als de vier types die vanaf Manta hebben gevlogen.

In 1999 tekende de regering van president Jamil Mahuad een overeenkomst waardoor Amerikaanse troepen Manta gratis mochten gebruiken voor vluchten in de strijd tegen drugssmokkel. Volgens de Engelstalige Wikipedia konden er tot 475 Amerikaanse militairen gestationeerd worden en voerden E-3 Sentry AWACS-vliegtuigen en P-3 Orion-gevechtsvliegtuigen van de Amerikaanse marine ongeveer 100 missies per maand uit om drugsschepen te onderscheppen die vanuit Colombia vertrokken. In 2007, zo meldt dezelfde bron, was de operatie betrokken bij ongeveer 200 inbeslagnames van in totaal zo'n 230 ton cocaïne, ongeveer 60 procent van de Amerikaanse drugsonderscheppingen in de oostelijke Stille Oceaan.

De regering van Rafael Correa wilde niet dat het doorging. Op 19 maart 2008 verbood de grondwetgevende vergadering buitenlandse militaire bases, op 26 juli 2008 liet Ecuador de Verenigde Staten formeel weten dat het huurcontract niet zou worden verlengd, en de laatste Amerikaanse antidrugsmissie vertrok op 17 juli 2009. De operatie verplaatste zich naar Palanquero in Colombia.

De eerste Super Tucanos uit Ecuador arriveerden in 2010: in totaal 18, nadat de bestelling was teruggebracht van 24 om geld vrij te maken voor Cheetahs. De Engelstalige Wikipedia vermeldt twee squadrons op Manta: 2313 "Halcones" voor grensbewaking en training en 2311 "Dragones" voor de bestrijding van opstanden. Halcones vierde zijn 60-jarig jubileum tijdens een commando-overdracht in augustus 2026, waarbij de wing ook zijn TOP GUN van het jaar benoemde.

Nu de Cheetah weg is, is de A-29 het enige gevechtsvliegtuig van de FAE, en Manta ligt aan de kust waar een groot deel van de cocaïne van Ecuador wordt verscheept. In april 2026 trainden FAE Super Tucanos met Super Hornets van de Amerikaanse marine vanaf de USS Nimitz, en in september 2026 noemde Infodefensa, op basis van een CNN-bericht, Manta als een mogelijke basis voor Amerikaanse MQ-9A Reaper-operaties – een plan dat door geen van beide regeringen was bevestigd.

Van 14 tot en met 19 september 2026 was Ala de Combate 23 gastheer voor de Peruaanse luchtmacht voor UNIDOS V, de vijfde editie van een gezamenlijke oefening. De Peruaanse luchtmacht liet weten dat de twee krijgsmachten gezamenlijke operaties tegen transnationale georganiseerde misdaad, zoek- en reddingsoperaties en interoperabele communicatie langs de grens oefenden. Voor twee luchtmachten die in 1981 en 1995 om de Cordillera del Cóndor vochten, was dit een onopvallend persbericht, en dat is precies de bedoeling.

De oefening vond plaats een jaar nadat de commandant van de Ecuadoraanse luchtmacht, generaal del Aire Celiano Cevallos Calderón, zijn Peruaanse collega in mei 2025 had onderscheiden voor interinstitutionele samenwerking, en sloot aan bij de huidige taak van de eenheid: de twee luchtmachten houden zich nu langs hun gedeelde grens vooral bezig met het bestrijden van drugshandel in plaats van elkaar.