Muito antes de se tornar uma base aérea, Palanquero era uma fazenda de gado às margens do rio Magdalena, a antiga estrada da Colômbia para o Caribe. Segundo a Wikipédia em inglês, a Fazenda Palanquero serviu como aeródromo para a companhia aérea colombiano-alemã SCADTA a partir de 1919, ano em que a Lei 126 criou a aviação militar colombiana. Hidroaviões e, posteriormente, aviões terrestres, faziam escala ali na rota que ligava Barranquilla ao interior do país.

A guerra com o Peru transformou o local em uma base militar. Civis e tropas peruanas tomaram Leticia, na Amazônia, em 1º de setembro de 1932, e a Colômbia, que possuía poucas aeronaves e nenhuma base perto da fronteira, comprou aviões no exterior às pressas. A Wikipédia afirma que o governo escolheu Palanquero em 1932 como uma base militar de localização central; o presidente Enrique Olaya Herrera a inaugurou em 27 de agosto de 1933 como o aeroporto nacional para La Dorada. Quando o conflito terminou, as bases na Amazônia foram desmanteladas e seus homens transferidos para novas bases, como Tres Esquinas, Palanquero e San José del Guaviare, de acordo com o histórico da Força Aérea na Wikipédia em inglês.

Palanquero tornou-se a base aérea para jatos na década de 1950. A Wikipédia em espanhol registra bombardeiros A-26C Invader alocados a partir de 1955 e caças Canadair Sabre Mk 4 a partir de 1956. A Colômbia atingiu a velocidade supersônica em 1972 com dezoito Mirage 5, e o modelo ainda voava a partir de Palanquero em 2009: em 15 de maio daquele ano, o Mirage 5 FAC 3031 não conseguiu decolar e seu piloto ejetou.

O Kfir israelense veio em seguida. A Colômbia comprou doze Kfir C2 ex-israelenses e um TC2 entre 1989 e 1990 e os modernizou para o padrão C7; em fevereiro de 2008, assinou contrato para a aquisição de mais 24 aeronaves ex-israelenses, e a frota voa hoje como Kfir C10/C12, a designação usada pela Infodefensa. A Wikipédia em inglês contabilizou 23 Kfirs em serviço em 2019. Eles são operados pelo Esquadrão de Combate 111 'Dardos', o único esquadrão de caça da Colômbia, e têm sido amplamente utilizados em ataques terrestres contra a guerrilha. O fim da frota de Kfir foi anunciado pelo presidente Gustavo Petro em abril de 2025, e o primeiro foi aposentado como aeronave de patrulha em maio de 2025. No entanto, a Infodefensa relatou que aeronaves Kfir C10/C12 estavam realizando patrulhas armadas sobre o norte do país sob ordens do presidente Abelardo de la Espriella em setembro de 2026.

Em 30 de outubro de 2009, a Colômbia e os Estados Unidos assinaram um acordo suplementar sobre cooperação em defesa e segurança. O Tribunal Constitucional da Colômbia lista as instalações que o país abriu ao pessoal americano: as bases aéreas Germán Olano Moreno em Palanquero, Alberto Pauwels Rodríguez em Malambo e Luis Fernando Gómez Niño em Apiay, os fortes do exército de Tolemaida e Larandia e as bases navais de Cartagena e Bahía Málaga. Um relatório do Serviço de Pesquisa do Congresso dos EUA, de 2012, observa que o acordo, que permitiu que tropas americanas utilizassem sete instalações militares, “inflamou ainda mais” o presidente da Venezuela, Hugo Chávez.

O acordo não resistiu à revisão constitucional colombiana nessa forma. No Acórdão 288, de 17 de agosto de 2010 (processos D-7964 e D-7965, relator Jorge Iván Palacio Palacio), o Tribunal Constitucional decidiu que o texto criava novas obrigações para a Colômbia, além dos acordos de cooperação de 1952, 1962 e 1974, que, portanto, se tratava de um tratado e que não poderia produzir efeitos até que fosse aprovado pelo Congresso e pela revisão automática do Tribunal. As ações das forças estadunidenses em Palanquero, sob acordos anteriores, estão fora do escopo da decisão do Tribunal e não serão descritas aqui.

A Colômbia assinou um contrato para a aquisição de 17 caças Saab Gripen em meados de novembro de 2025; a Infodefensa noticiou a cerimônia de assinatura em 14 de novembro, aniversário da Força Aérea. A Saab anunciou o contrato em 15 de novembro de 2025, no valor de € 3,1 bilhões, para 15 caças Gripen E monoposto e dois Gripen F biposto, com entregas previstas entre 2026 e 2032; a Infodefensa reportou o preço como US$ 1.402 bilhões e descreveu todos os 17 caças como modelo E. Os valores apresentados aqui são os da Saab.

Palanquero será a sua base. Segundo a Infodefensa, a Força Aérea assinou um contrato de US$ 1.000.000 (cem mil e 91 mil dólares) com o Consórcio ASA em 31 de dezembro de 2025 para um hangar principal de dois andares com 7.800 m², oito posições de estacionamento e duas de reparo, oito abrigos tipo bunker, um bunker de reação com quatro posições para aeronaves e postos de tripulação, um laboratório de guerra eletrônica para o Gripen, um centro de treinamento tático de 1.650 m² com quatro simuladores e 35.410 m² de novo pátio de manobras. A conclusão da obra está prevista para 30 de novembro de 2028.