O aeródromo de Rayak é mais antigo que o próprio Estado libanês. A história escrita por Christian Kirchen para o Goethe-Institut traça a origem da primeira pista, "uma simples trilha de areia", a um regimento aéreo bávaro fundado em Oberschleißheim em 1912 e enviado para a frente otomana durante a Primeira Guerra Mundial; a Wikipédia em inglês data a pista de 1914 e atribui o mérito a engenheiros alemães. Dois edifícios revestidos de aço corrugado, provavelmente hangares, e uma construção com estrutura de madeira perto da pista ainda existem daquela época, e um ensaio fotográfico de 2021 sobre a base observa que os antigos quartéis dos engenheiros alemães ainda estão em uso.

Sob o mandato francês que se seguiu à Primeira Guerra Mundial, Rayak tornou-se uma base francesa. Um relato dos primeiros anos da força aérea, republicado pela GlobalSecurity, a descreve como a "joia" das bases aéreas sob o mandato. Na Segunda Guerra Mundial, passou para o controle da França de Vichy, e o Instituto Goethe registra que pilotos alemães a caminho de Bagdá receberam permissão para pousar no Vale do Bekaa. Quando as forças britânicas e australianas invadiram a Síria e o Líbano em junho de 1941, a 25ª Brigada Australiana recebeu a missão de avançar sobre o que a Wikipédia chama de a grande base aérea francesa de Vichy em Rayak.

A mesma reportagem fotográfica lista o que restou daquelas décadas: hangares de metal ondulado construídos para combatentes de Vichy, um hospital militar francês abandonado e uma prisão da época da guerra. Ela contabiliza o controle da base por alemães, otomanos, franceses, franceses de Vichy, australianos, franceses livres, libaneses e sírios, antes de sua devolução ao Líbano. O período sírio é um relato do autor e não foi confirmado por nenhuma fonte oficial.

O Líbano assumiu o comando de Rayak em 1º de agosto de 1945, de acordo com a Wikipédia em inglês, mas a força aérea francesa permaneceu até 1949. Quando partiu, a reconstrução do prédio administrativo, dos hangares e da torre de controle levou mais de dois meses, segundo o relato republicado pela GlobalSecurity. O Exército Libanês data a fundação da força aérea em 10 de junho de 1949, em Rayak, sob o comando do Tenente-Coronel Emile Boustany; a GlobalSecurity e a Wikipédia indicam 1º de junho, e a GlobalSecurity afirma que Boustany foi designado para a função em 13 de maio de 1949.

As primeiras aeronaves foram Percival Prentices e Proctors, e os primeiros instrutores eram estrangeiros: quatro da Força Aérea Real Britânica (RAF), dois ex-pilotos da Luftwaffe que haviam treinado pilotos sírios, italianos e um destacamento francês, segundo o mesmo relato. A primeira turma de pilotos se formou em 1º de julho de 1952. A revista MILAVIA descreve Rayak como a única base da força aérea naqueles anos, sede do esquadrão de treinamento.

As fontes divergem sobre quando o quartel-general deixou o local. A GlobalSecurity afirma que o comando da força aérea se mudou para Beirute em 1º de dezembro de 1954, quando Rayak se tornou um comando independente sob o comando do Coronel Wajih Karam; a própria história do Exército Libanês diz que o quartel-general permaneceu em Rayak até 1969, quando foi transferido para o Ministério da Defesa Nacional.

Quando o exército se dividiu em 1976, a maior parte dos recursos aéreos da força aérea estava em Rayak, com os helicópteros em Beirute e os Mirages em Kleyate. O artigo da Wikipédia em inglês sobre o Exército Árabe Libanês dissidente afirma que sua facção pró-Síria, a Vanguarda, tinha seu quartel-general em Rayak e que seus homens estavam, em sua maioria, confinados a quartéis ou guardando a base aérea adjacente.

Em setembro de 1983, durante a Guerra da Montanha, Rayak foi bombardeada pelo Exército Sírio, de acordo com o relato da Wikipédia sobre essa guerra, e os caças Hunter foram transferidos para uma pista improvisada em Halat, na costa perto de Biblos. Os caças Hunter foram desativados em 1994.

Em 13 de julho de 2006, o segundo dia da guerra entre Israel e o Hezbollah, aviões israelenses atacaram Rayak e o aeroporto militar de Qlayaat, no norte do país, destruindo suas pistas. A cronologia da guerra na Wikipédia registra a alegação de Israel de que as pistas eram usadas pelo Hezbollah para transferir suprimentos e observa que esses foram os primeiros ataques contra o exército libanês naquele conflito. O governo libanês considerou a resposta de Israel desproporcional e pediu um cessar-fogo.

Em agosto de 2007, após a batalha de Nahr al-Bared, o exército decidiu reativar seus caças Hunter; a falta de peças de reposição, incluindo cartuchos para os assentos ejetáveis Martin-Baker, atrasou o processo. Em 12 de novembro de 2008, cinquenta anos após a entrada do modelo em serviço no Líbano, quatro dos oito Hunters sobreviventes, um biposto e três monopostos, retornaram ao serviço com o 2º Esquadrão em Rayak, de acordo com a Wikipédia em inglês. A MILAVIA contabilizou quatro Hunters operacionais em Rayak em 2011: três FGA.70 e um T.66.

A situação não durou muito. O comandante da Força Aérea, Brigadeiro-General Ziad Haikal, declarou ao Defense News em 2021 que os Hunters estavam inoperantes desde 2010 por falta de verba; eles foram formalmente aposentados em 2014. Em agosto de 2021, cinco Hunters e suas peças de reposição foram oferecidos à empresa canadense Lortie Aviation por cerca de 1 milhão de libras esterlinas, para serem usados como aeronaves adversárias em treinamento.

Dois Hunters permaneceram em Rayak para o museu. O museu da força aérea ocupa um único hangar e não está aberto ao público; as visitas precisam da permissão da força aérea. O Museu da Aviação da UE lista oito aeronaves: Vampire T.55 L-154, Hunter F.6 L-271, Alouette II L-302, Alouette III L-329, AB212 L-557, Magister L-602 e Gazelles L-801 e L-809. A lista da Wikipédia adiciona um T-6 e o único de Havilland Dove da força aérea.